日本におけるデルタ変異の急速な消失の背景は何ですか？ それは自消である場合もある。
なぜ、世界的に類を見ないデルタ変異によって引き起こされたコロナウイルス流行の第 5 波と最大の波が、新しい感染の急激な増加に伴って突然突然終わりになったのでしょうか？ また、日本は、新たなケースで新たなサージが発生している先進国とは何が違うのでしょうか。
ある研究者グループによると、デルタ変異体が「自己消滅」の行動で自らを治療したことが驚くべき結果になるかもしれないという。
デルタ変異が全国のケースロードの記録を更新した 3 ヵ月後、日本の新しい COVID-19 感染が急激に減少し、ここ数週間で 200 を下回った。 この減少を強調したのは、 11 月 7 日に死亡が報告されなかったことです。これは、約 15 ヵ月ぶりのことです。
多くの学者は、先進国の中で最も高いワクチン接種率の一つで、水曜日の時点で住民の 75.7 ％がフルワクチン接種を受けているなど、さまざまな可能性を指摘している。 その他にも、日本社会に深く根付いている社会的な距離やマスク着用対策などが考えられます。
しかし、主な理由は、コロナウイルスが複製中に受ける遺伝子の変化に関連している可能性があり、 1 ヵ月あたり約 2 回の突然変異ペースである。 国立遺伝学研究所の井上教授が提案した革命的な可能性のある理論によると、日本のデルタ変異は、 nsp14 と呼ばれるウイルスの誤り訂正、非構造タンパク質にあまりにも多くの変異を蓄積しているという。 その結果、ウイルスは時間内にエラーを修復するのに苦労し、最終的には「自己破壊」につながりました。
アジアには、ヨーロッパやアフリカの人々に比べて、 COVID-19 を引き起こす SARS-COV-2 ウイルスなど、 RNA ウイルスを攻撃する APOBEC3A と呼ばれる防御酵素が多く存在することが研究により示されています。
そこで、国立遺伝学研究所と新潟大学の研究者たちは、 APOBEC3A タンパク質が nsp14 タンパク質にどのように影響し、コロナウイルスの活動を阻害できるかどうかを解明することにした。 同博士のチームは、 6 月から 10 月にかけて、日本の感染した臨床標本から得られたアルファ変異体およびデルタ変異体の遺伝的多様性データの解析を実施した。
その後、 ウイルスの DNA 配列間の関係を視覚化し、ハプロタイプネットワークと呼ばれる図に遺伝子多様性を示した。 一般的に、ネットワークが大きいほど、ネットワークが表すプラスのケースが多くなります。
月から 6 月にかけて日本の第 4 波を推進していたアルファバリアントのネットワークには、 5 つの主要なグループがあり、多くの変異が分岐し、遺伝的多様性が高いことが確認されていました。 このデルタ変異体は、米国疾病管理予防センターが以前の変異体と比べて 2 倍以上の感染性があり、非ワクチン接種を受けていない人々により重度の疾患を引き起こす可能性があると主張しているが、遺伝子の多様性ははるかに活発になるだろうと研究者たちは考えている。
意外にも、彼らは反対に本当であることを見つけた。 ハプロタイプのネットワークには 2 つの主要なグループしかなく、進化の過程の途中で突然変異が突然停止したようだ。 研究者らは、このウイルスの誤り訂正酵素 nsp14 を調べたところ、日本の nsp14 検体の大部分が A394V と呼ばれる突然変異部位で多くの遺伝的変化を経験したように思われることを発見した。
井上氏は日本の時代にこう語った。「私たちは文字通り、この発見を見るためにショックを受けた。 「日本のデルタ変異体は非常に可搬性が高く、他の変異体を排除していた。 しかし、突然変異が蓄積されると、最終的にはウイルスの欠陥となり、それ自体のコピーを作ることができなかったと考えています。 ケースが増えていないことを考えると、このような変異の発生時には、ある時点で自然絶滅の方向に向かって進んでいると考えています」と述べています。
井上氏の理論は、革新的だが、デルタ変異の日本への拡散が不可解になったことを裏付けるものになるだろう。 韓国や一部の西側諸国など、同様に高いワクチン接種率を持つその他の国々の多くは、新たな感染の記録的な波に苦しんでいますが、 日本は、最近の緊急事態が終わり、列車やレストランが満車になったにもかかわらず、 COVID-19 事件が依然として沈み続けているという特異なケースのようだ。
「もしウイルスが生きていても、場合によってはマスキングやワクチン接種によって画期的な感染を防ぐことができないため、確実に感染が増加すると考えられます」と井上氏は述べています。
ウラノ武氏によると、実際、夏の波に続く新たなケースでの予想外の飛び込みは、コロナウイルスに関する研究を行わない専門家を含め、多くの専門家の間で議論されてきたという。 島根大学医学部教授で、井上教授の研究には関わっていません。
「 Nsp14 は他のウイルスタンパク質と連携し、ウイルス RNA が分解するのを防ぐ重要な機能を持っています」と井上氏は述べ、その結果について尋ねました。 「調査によると、 nsp14 が機能不全になったウイルスは複製能力が大幅に低下しているため、新しいケースでの急速な減少の 1 つの要因になる可能性があります。 nsp14 はウイルス由来であり、このタンパク質を抑制する化学物質は有望な医薬品になる可能性があり、すでに開発が進んでいます」と述べています。
日本は、デルタ変異体が 8 月下旬までにアルファやその他の変異体を事実上閉鎖しているという点で、異例のようです。 一方、インドやインドネシアなどの他の国々は、特にデルタ変異によって大きな打撃を受けていましたが、これらの国では、アルファとデルタの歪みが混在していることが報告されています。
井上氏によると、コロナウイルスの自然絶滅は海外でも見られる可能性があるという。また、他の国が日本と同様に多くの変異を に蓄積していないように見えるため、それを検出するのは難しいだろう、と付け加えた。 A394V のサイトでは、同様の変異が少なくとも 24 の国で発見されている。
しかし、 2003 年に重症急性呼吸器症候群（ SARS ）の発生が突然終了した理由についても、井上教授の理論が説明できるかもしれない。 研究者たちがウイルス中の nsp14 に突然変異を引き起こし、 SARS の原因となった in vitro 実験の結果、ウイルスは最終的に突然変異が蓄積されたときに自らを複製することができなかったことが判明した。
「ゲノムデータは存在しないため、仮説に過ぎません。しかし、データが消失したため、再び光が見えなくなることはありません」と、博士は述べています。
では、 SARS の原因となっている SARS-COV-2 ウイルスが、海外でも同様の自然絶滅の危機にさらされる可能性はどのくらいあるのでしょうか？
「可能性はゼロではありませんが、今のところは楽観的すぎるようです。他の国の様々なデータを見てきたにもかかわらず、このような証拠を得ることができないからです」と彼は言います。
8 月中旬以降、日本では 1 日の COVID-19 ケースで 9 月中旬までに 5 、 000 ケースを下回り、 10 月下旬には 200 ケースを下回っている。 この国は、先進国の中で一番低い感染率を享受しているが、次の流行の影響を受けないと井上氏は言う。
「明らかに脅威があります」と彼は言います。 「デルタバリアントがあったので、すべてが正しい結果になりました。 他の亜種は少しずつ先行していますが、日本のデルタがそれを抑えていました。 しかし今ではそれらを湾に保つために何もないのでワクチンだけが問題を解決しないので新しい物が入るために部屋がある。 その意味で、入国管理の検疫措置は非常に重要だと思います。なぜなら、外国から何が来ているのかがわからないからです」
日本のデルタ変異体の自己消滅は、日本人の遺伝的構成に特別な原因があるのかと疑問に思う人もいるかもしれないが、井上氏はこれには同意しない。
「私はそうは思いません」と彼は言います。 「韓国人のような東アジアの人々は、日本人と倫理的に同じだ。 しかし、なぜ日本でこの観測が行われたのかはわかりません。」
井上氏は、国立遺伝学研究所と新潟大学の研究者チームが、 11 月末までに研究成果をまとめようと計画していると述べた。