To zależy od aktualnych sterowników. Są karty które kopią lepiej pod Windowsem, są też i takie które lepsze są pod Linuxem. Nie ma reguły.

Dla przykładu mojej GTX 1080 nie robi to różnicy kto nią rządzi i na obu mam 26MH/s (podkręcona z wgranym bios'em) :)
Preferuję Linuxa bo jest łatwiejszy w zarządzaniu.

Nvidie są słabe do kopania względem AMD ale o tym jeszcze będę pisał dokładniej - różnica jest w ilości procesorów. Nvidia daje ich mniej ale z szybszym zegarem, a AMD woli dorzucić ich 2x tyle ale wolniejszych.