Deine Kritik kann ich soweit nachvollziehen und sie deckt sich auch mit den noch existierenden Problemen mit ipfs.
Was die Gefahr von fremden Content auf dem eigenen Node betrifft so ist die Standardkonfiguration keinen Content automatisch hinzuzufügen.
Hier lässt sich der Content manuell pinnen mit ipfs pin add ipfshash.
(pinnen bedeutet Datei herunterladen um diese dem Netzwerk zur Verfügung zu stellen.)

Um zu deinem Spezifischen Problem zu kommen:
Die 480p Datei ist wohl tatsächlich verloren. Wenn du die sourcedatei noch hast kannst du diese in deinem ipfs node erneut hinzufügen.

Der ipfshash sollte mit dem ursprünglichen übereinstimmen.
Ich glaube das hier ist der Hash deines ersten Videos: QmYhikN8qBFCiJ2EV7r4wUXtsnML6xHbPmt24SW8LXoM1r
wenn du es nur testen möchtest kannst du auch mittels "ipfs add -n Dateiname" nur den Hashwert der Datei bestimmen und vergleichen.

Sollte er übereinstimmen kannst du die Datei erneut hinzufügen mit "ipfs add Dateiname"
Nun sollte die Datei wieder verfügbar sein. (Vorerst nur solange dein node läuft)